En raison de l'extrême persistance des PFAS, la prévention est la première ligne de défense. Il s'agit de minimiser l'utilisation des PFAS, d'améliorer les processus et les pratiques de gestion des déchets, et de mettre en œuvre les principes du pollueur-payeur pour tenir les pollueurs responsables des émissions et de la remise en état.
Dans les chaînes de traitement de l'eau, certaines technologies permettent de réduire les concentrations de PFAS dans l'eau de traitement et l'eau potable, comme la filtration avancée (osmose inverse, nanofiltration), les technologies d'adsorption (par exemple, le charbon actif) ou les traitements oxydatifs avancés. Il s'agit de processus coûteux où les résidus de traitement nécessitent une attention particulière. Par conséquent, la prévention et la gestion des sources restent un élément essentiel de la gestion des risques.